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Passaggi Per La Risoluzione Dei Problemi Di Inferenza Di Rete Normativa Basati Sul Kernel

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In questo gentile tutorial, mostreremo alcune delle possibili cause che possono innescare un’assoluta inferenza della rete di telefonia mobile di regolamentazione genetica basata sul nucleare, e poi ti suggerirò un piccolo numero di possibili metodi di ripristino che potresti provare a risolvere questo problema.

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  • Proponiamo un’opzione basata sul kernel per derivare reti regolatorie originate da dati di espressione genica che sfrutta diversi fattori utili precedentemente trascurati nel documenti, inclusi clustering ciclico, connessioni non lineari del gene regolatore, variabili di ritardo del tempo libero e tornei genetici. In particolare, il corso d’azione individuale inferisce relazioni regolatorie tra geni buoni da modelli di espressione simili quando è necessario utilizzare regolatori generali. Poiché la relazione tra il regolatore e il concetto genetico non è generalmente lineare, ma particolarmente soggetta a una più ampia classe inversa di relazioni canalizzate, mappiamo le nostre stesse relazioni tra fattori di trascrizione nel tipo di spazio esclusivo di una dimensione agita superiore che può solo modellare discussioni molto più complesse. Questo approccio basato sul kernel aiuta a prevenire il confronto delle regole enumerative altamente rivelatore consentendo di rilevare relazioni non lineari tra i fattori di trascrizione. Terzo, in modo che risolva tutti i problemi, dati di comunicazione contenenti ritardi diversi nei punti normativi, utilizzo davvero una spline di interpolazione cubica per aiutare a determinare tempi di ritardo più accurati da livelli di espressione campionati in modo discreto, fattibile per un’inferenza più affidabile di crepe normative. Infine, modelliamo la concorrenza sui geni; un effetto che non è stato chiaramente modellato dai metodi precedenti. La combinazione di queste estensioni significa il fatto che le relazioni causali tra i geni regolatori in molti casi possono essere stabilite in modo più accurato sulla base dei dati di espressione genica.

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    inferenza della rete di regolazione genica basata sul kernelRivedi il testo completo all’interno dell’intero studio,
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